ForHosting KIT · أدوات المطورين

حاسبة الشحنة الصافية للبروتين حسب الأس الهيدروجيني

تقدّر حاسبة الشحنة الصافية للبروتين الشحنة الكهربائية للببتيد عند قيمة pH تختارونها، اعتمادًا على أعداد مجموعاته القابلة للتأين.

● Betaمجاني · داخل متصفحك

شغّل الأداة مجانًا اطّلع على الـAPI

استخدمها من الويبAPIالبريدTelegramالتطبيق قريبًا

أدخلوا أعداد بقايا اللايسين والأرجينين والهيستيدين والأسبارتات والغلوتامات والسيستئين والتيروزين، ثم أضيفوا النهايات الحرة. تتوفر قيم قياسية افتراضية لـpKa، ويمكنكم تعديل كل قيمة لتناسب النموذج التجريبي المعتمد. تعرض النتيجة الشحنة الموجبة والسالبة والصافية، إلى جانب تفصيل مساهمة كل مجموعة، كي تتمكنوا من مراجعة الحساب بدلًا من تلقي رقم منفرد بلا تفسير.

حوّلوا تركيب الببتيد إلى شحنة تقديرية

لا يحمل الببتيد شحنة ثابتة واحدة في جميع الظروف. تستطيع المجموعات القاعدية استقبال البروتونات فتسهم بشحنة موجبة، بينما تستطيع المجموعات الحمضية فقد البروتونات فتسهم بشحنة سالبة. يتغير التوازن بينهما بصورة مستمرة مع قيمة pH. لاستخدام الحاسبة، احسبوا السلاسل الجانبية القابلة للتأين: اللايسين والأرجينين والهيستيدين في الجانب القاعدي، والأسبارتات والغلوتامات والسيستئين والتيروزين في الجانب الحمضي. بعد ذلك، حددوا عدد النهايات N وC الحرة. يحتوي الببتيد الخطي المعتاد غالبًا على نهاية واحدة من كل نوع، ولذلك تبدأ الخانتان بالقيمة واحد. اجعلوا العدد صفرًا إذا كانت النهاية محجوبة كيميائيًا أو مُمَيهدة أو مُستَلة أو مرتبطة ضمن ببتيد حلقي أو غير متاحة للتأين المعتاد. تطبق الحاسبة قيمة pH المختارة على كل مجموعة وتجمع شحناتها الكسرية. لذلك تقدم تقديرًا متصلًا مثل 1.42 بدل افتراض أن كل مجموعة مشحونة بالكامل أو غير مشحونة تمامًا. تكون هذه النتيجة الكسرية مفيدة خصوصًا عند مقارنة ظروف قريبة من قيمة pKa.

كيفية تطبيق كسور Henderson–Hasselbalch

يستخدم الحساب لكل مجموعة قاعدية كسر البروتنة: 1 مقسومًا على 1 زائد 10 مرفوعًا إلى أس pH ناقص pKa. يُضرب هذا الكسر في عدد المجموعة للحصول على مساهمتها الموجبة. أما كل مجموعة حمضية فيستخدم لها كسر نزع البروتون: 1 مقسومًا على 1 زائد 10 مرفوعًا إلى أس pKa ناقص pH، ثم يُضرب في العدد وتوضع له إشارة سالبة. تُجمع المساهمات الموجبة والسالبة كلها، ويكون مجموعها الشحنة الصافية المقدرة. تعرض الاستجابة التفصيلية العدد وقيمة pKa والكسر المتأين ومساهمة الشحنة لكل مجموعة مدعومة، حتى عندما يكون عددها صفرًا. توفر قيم pKa الافتراضية تقديرًا عامًا عمليًا، لكنها ليست ثوابت فيزيائية شاملة. قد يغيّر سياق التسلسل والتعرض للمذيب والقوة الأيونية ودرجة الحرارة والشحنات المجاورة والطريقة التجريبية قيمة pKa الفعلية. إذا كانت لديكم قيم مقاسة أو خاصة بنموذج معين، فأدخلوها مباشرة. إن إظهار الافتراضات يجعل المقارنات قابلة للتكرار ويمنع الخلط بين القيمة الافتراضية وخاصية محددة تجريبيًا.

فسّروا التقدير واعرفوا حدوده

تشير الشحنة الصافية إلى اتجاه شحنة الجزيء ومقدارها التقريبي وفق الافتراضات المدخلة. تعني النتيجة الموجبة أن المجموعات القاعدية المبرتنة تفوق المجموعات الحمضية المنزوعة البروتون، بينما تعني النتيجة السالبة أن المساهمات الحمضية هي الغالبة. تشير القيمة القريبة من صفر إلى تعادل كهربائي تقريبي عند قيمة pH تلك، لكن هذه الحاسبة لا تحسب نقطة التعادل الكهربي ولا تبحث عبر عدة قيم من pH. كما أنها لا تستنتج الأعداد من تسلسل الأحماض الأمينية، ولا تنمذج الاقتران البنيوي، ولا تضيف العوامل المساعدة أو تعديلات ما بعد الترجمة تلقائيًا، ولا تتنبأ بالحركة الرحلانية أو الذوبانية. أضيفوا المجموعات التي تمثلها الخانات المتاحة فقط، وعدّلوا أعداد النهايات وقيم pKa عندما تتطلب الصيغة الكيميائية ذلك. يفيد الحساب في فحوص التصميم السريعة والتعليم ومقارنة المحاليل المنظمة والفحص القابل للتكرار للتراكيب المعروفة. بالنسبة إلى البروتينات المطوية أو البيئات المجهرية غير المعتادة أو القرارات التي تتطلب سلوكًا تجريبيًا دقيقًا، عاملوا النتيجة كتقدير وقارنوها بنموذج pKa يراعي البنية أو بقياس مختبري. تبلغ تكلفة الأتمتة عبر API مقدار $0.002 لكل طلب، ويمكن تشغيل الحساب الحتمي نفسه في المتصفح.

حالات الاستخدام

مقارنة ظروف المحلول المنظم

قدّروا تغير شحنة تركيب الببتيد نفسه بين قيم pH المرشحة للتجربة.

مراجعة تصميم الببتيد

تحققوا مما إذا كانت الاستبدالات أو النهايات المحجوبة تدفع الببتيد نحو شحنة موجبة أو سالبة.

شرح السلوك الحمضي القاعدي

بيّنوا كيف تسهم البروتنة الكسرية لكل فئة من البقايا في المجموع دون استخدام تقريب ثنائي.

الأسئلة الشائعة

ماذا تمثل النتيجة؟

هي تقدير لمتوسط الشحنة الصافية لكل جزيء ببتيد عند قيمة pH المدخلة، بناءً على التأين المستقل للمجموعات المحسوبة.

ما قيم pKa الافتراضية المستخدمة؟

القيم هي 10.5 للايسين، و12.5 للأرجينين، و6.0 للهيستيدين، و3.9 للأسبارتات، و4.1 للغلوتامات، و8.3 للسيستئين، و10.1 للتيروزين، و8.0 للنهاية N، و3.1 للنهاية C.

هل ينبغي حساب النهايات المحجوبة؟

لا. اجعلوا عدد النهاية المعنية صفرًا عندما تكون محمية أو حلقية أو غير متاحة للتأين وفق النموذج المستخدم.

لماذا قد تكون الشحنة الصافية كسرية؟

يكون متوسط مجموعة الجزيئات المتطابقة كسريًا لأن المجموعة القابلة للتأين تكون مبرتنة أو منزوعة البروتون في جزء من الجزيئات فقط قرب قيمة pKa.

هل تحسب الأداة نقطة التعادل الكهربي؟

لا. تقيّم الأداة قيمة pH مدخلة واحدة. أما حساب نقطة التعادل الكهربي فيبحث عن قيمة pH التي تصبح عندها الشحنة الصافية في النموذج صفرًا.

كم تبلغ تكلفة طلب API؟

تبلغ تكلفة كل طلب API مقدار $0.002. ويستخدم الحساب في المتصفح المنطق الحتمي نفسه.

للمطوّرين — الوصول عبر API

كل ما في هذه الصفحة متاح برمجيًا. هذا القسم موجّه للفرق التقنية التي تريد ربط الأداة بأنظمتها الخاصة؛ بقية المستخدمين يمكنهم استخدام الأداة أعلاه مباشرة دون الحاجة لقراءة ما يلي.

الـEndpoint

POSThttps://api.kit.forhosting.com/bio/protein-net-charge

صادِق على طلبك بترويسة Bearer، وأرسل طلب POST واحدًا لتدخل مهمتك قائمة التنفيذ فورًا؛ ثم تستلم النتيجة عبر webhook أو رابط موقّع.

استدعِ الخدمة من بيئتك

curl -X POST https://api.kit.forhosting.com/bio/protein-net-charge \
  -H "Authorization: Bearer $KIT_KEY" \
  -H "Content-Type: application/json" \
  -d '{"ph":7.4}'

const res = await fetch("https://api.kit.forhosting.com/bio/protein-net-charge", {
  method: "POST",
  headers: {
    "Authorization": `Bearer ${process.env.KIT_KEY}`,
    "Content-Type": "application/json"
  },
  body: JSON.stringify({
    "ph": 7.4
  })
});
const { task_id } = await res.json();

import os, requests

res = requests.post(
    "https://api.kit.forhosting.com/bio/protein-net-charge",
    headers={"Authorization": f"Bearer {os.environ['KIT_KEY']}"},
    json={
    "ph": 7.4
},
)
task_id = res.json()["task_id"]

<?php
$res = file_get_contents("https://api.kit.forhosting.com/bio/protein-net-charge", false, stream_context_create([
  "http" => [
    "method"  => "POST",
    "header"  => "Authorization: Bearer " . getenv("KIT_KEY") . "\r\nContent-Type: application/json",
    "content" => '{"ph":7.4}',
  ],
]));
$task = json_decode($res, true);

body := bytes.NewBufferString(`{"ph":7.4}`)
req, _ := http.NewRequest("POST", "https://api.kit.forhosting.com/bio/protein-net-charge", body)
req.Header.Set("Authorization", "Bearer "+os.Getenv("KIT_KEY"))
req.Header.Set("Content-Type", "application/json")
res, _ := http.DefaultClient.Do(req)

مثال على الطلب

{
  "ph": 7.4
}

مثال على الاستجابة

{
  "task_id": "tsk_a1b2c3d4e5f6a1b2c3d4e5f6",
  "type": "bio.protein_net_charge",
  "status": "queued",
  "_links": {
    "result": "/tasks/tsk_…/result"
  }
}

الواجهة غير متزامنة: تستلم task_id فور الإرسال، ويمكنك الاستعلام عن الحالة بمعدل طلب واحد في الثانية.

الأسعار

لكل طلب$0.002

السعر معلن كما تراه: لا tokens ولا نظام نقاط؛ وإن فشلت المهمة فلن تُحاسَب عليها.

الأخطاء

HTTP	الرمز	المعنى
`401`	`unauthorized`	مفتاح الوصول مفقود أو غير صالح؛ تحقق من ترويسة Bearer في طلبك.
`402`	`insufficient_balance`	رصيدك لا يكفي لتنفيذ هذه المهمة؛ أعد شحن الرصيد ثم أعد المحاولة.
`404`	`unknown_type`	نوع المهمة المطلوب غير موجود في الكتالوج — راجع الاسم المرسل في الطلب.
`429`	`rate_limited`	تجاوزت الحد المسموح من الطلبات؛ انتظر قليلًا ثم أعد المحاولة.

اطّلع على توثيق KIT الكامل ←