Calculadora de vueltas helicoidales del ADN

Emplea la aproximación habitual para el ADN de forma B de 10.5 pares de bases por vuelta y muestra tanto el supuesto como la fórmula junto al resultado. Introduzca una longitud entera no negativa para obtener un valor determinista útil en estimaciones de laboratorio, docencia, notas de protocolos y procesos de software reproducibles. El cálculo no requiere una secuencia ni deduce la conformación del ADN a partir de las condiciones experimentales.

Introduzca la longitud del ADN en pares de bases

Indique la longitud total de la molécula de ADN como un número entero de pares de bases. Para un fragmento lineal, suele ser el tamaño obtenido mediante análisis de secuencia, un mapa de restricción, un ensamblaje o una estimación por electroforesis. Para un plásmido circular, use la longitud completa, incluidos el esqueleto y todas las secuencias insertadas. La calculadora admite cero como caso límite matemático y rechaza valores negativos, fraccionarios, no numéricos o enteros no seguros, porque una longitud en pares de bases es un recuento discreto. No introduzca nucleótidos de una sola cadena salvo que el recuento coincida con las posiciones apareadas de la molécula bicatenaria estudiada. Tampoco introduzca peso molecular, kilobases sin convertir ni longitud física de contorno. Convierta kilobases en pares de bases multiplicando por 1000. Mantener clara la procedencia de la longitud y su unidad evita que un sencillo error de escala se convierta en un resultado diez o mil veces incorrecto.

Comprenda el supuesto de 10.5 pares de bases

El cálculo divide entre 10.5 el número de pares de bases indicado, una repetición helicoidal media muy utilizada para el ADN de forma B. Por ejemplo, 105 pares de bases equivalen a 10 vueltas helicoidales con esta aproximación. Un resultado fraccionario es válido: expresa ese número de rotaciones medias, no que toda molécula deba terminar tras una vuelta completa. El resultado incluye el factor fijo y una fórmula legible para facilitar su comprobación y registro. El valor 10.5 es una convención idealizada, no una medición de la molécula enviada. La repetición real puede variar según la secuencia, hidratación, salinidad, temperatura, tensión torsional, unión de proteínas, compuestos intercalantes y topología. Otras formas estructurales, como A-DNA y Z-DNA, presentan geometrías distintas y no deben interpretarse con este factor. Utilice la herramienta cuando la aproximación de forma B sea adecuada y conserve siempre este supuesto al comunicar o comparar el resultado.

Use el resultado con la precisión adecuada

Considere el número obtenido como una estimación geométrica transparente. Puede servir para comparar longitudes de fragmentos, explicar el faseado rotacional, preparar ejemplos docentes, anotar diseños de constructos o incorporar un valor derivado uniforme a un flujo de datos. Si dos sitios están separados por un múltiplo entero de aproximadamente 10.5 pares de bases, quedan alineados de forma aproximada bajo el modelo simplificado; un desfase de media vuelta los sitúa aproximadamente en caras opuestas. Sin embargo, esta operación no predice curvatura, accesibilidad, actividad promotora, posición de nucleosomas, superenrollamiento ni interacciones entre proteínas y ADN. Esas cuestiones exigen contexto de secuencia y análisis experimentales o estructurales más detallados. No redondee la entrada, sobre todo en fragmentos cortos, pues un par de bases representa casi una décima de vuelta. Redondee el resultado solo hasta la precisión justificable para su aplicación. La API entrega un número estable para automatización y muestra el factor y la fórmula para facilitar la revisión. Cada cálculo mediante API cuesta $0.002; la misma operación determinista también puede usarse interactivamente.