ForHosting KIT · أدوات المطورين

حاسبة مسافة الخريطة الجينية مع تصحيح العبور المزدوج

تجمع حاسبة مسافة الخريطة الجينية الإضافية بين فترتين متجاورتين ضمن ترتيب معلوم لثلاثة جينات.

● Betaمجاني · داخل متصفحك

استخدمها من الويبAPIالبريدTelegramالتطبيق قريبًا

أدخل المسافة من الجين A إلى الجين B، ثم من الجين B إلى الجين C، واضبط معامل التطابق عند الحاجة، لتحصل على طول الخريطة الكلي وتقدير لمعدل إعادة التركيب بين الجينين الخارجيين بعد تصحيح العبور المزدوج. تفصل الأداة بين مسافة الخريطة وإعادة التركيب القابلة للرصد، ولذلك تفيد في تمارين علم الوراثة وتحليل التزاوج الاختباري والتحقق القابل للتكرار من حسابات الخرائط ثلاثية النقاط.

أدخل الفترتين المتجاورتين وفق ترتيب الجينات المعلوم

استخدم هذه الحاسبة بعد التحقق من أن ترتيب الجينات هو A-B-C. أدخل في الحقل الأول مسافة الخريطة بين A وB، وفي الحقل الثاني المسافة بين B وC. تقاس القيمتان بالسنتيمورغان، وتسمى هذه الوحدة أيضا وحدة الخريطة. تقبل الأداة لكل فترة قيمة من 0 إلى 50 سنتيمورغان. لا تستنتج الحاسبة ترتيب الجينات من فئات النسل، ولا تحدد الأنماط الظاهرية الأبوية أو المؤتلفة، ولا تختار الواسم الأوسط؛ بل يجب إنجاز تلك الخطوات مسبقا. تمثل الأحرف A وB وC أي ثلاثة جينات تختارها، بشرط أن يمثل B الجين الأوسط. لا تدخل مسافة بين الجينين الخارجيين بوصفها إحدى الفترتين، لأن ذلك سيؤدي إلى احتساب جزء من الكروموسوم مرتين. مسافة الخريطة الإضافية الناتجة هي مجموع A-B وB-C، وهي تصف المسار الكامل على خريطة الارتباط حتى عندما يخفض العبور المزدوج معدل إعادة التركيب المرصود بين A وC.

طبق تصحيح العبور المزدوج تطبيقا صحيحا

إذا افترضت عدم وجود تداخل، فاترك معامل التطابق عند قيمته الافتراضية 1. تحول الحاسبة النسبتين المئويتين للفترتين المتجاورتين إلى كسرين، ثم تضربهما لإيجاد تواتر العبور المزدوج المتوقع في حالة الاستقلال، وتعيد عرض الناتج كنسبة مئوية. إذا وفرت التجربة معامل تطابق، فأدخل قيمة بين 0 و1. يضرب التواتر المتوقع المستقل في هذا المعامل للحصول على التقدير المعدل. تشير القيمة الأقل من 1 إلى تداخل إيجابي، أي إلى حدوث حالات عبور مزدوج أقل مما يتوقعه نموذج الاستقلال. يجب طرح كل عبور مزدوج مرتين عند تقدير إعادة التركيب بين الواسمين الخارجيين، لأنه يدخل مرة في كل فترة متجاورة، لكنه يعيد ترتيب الجينين الخارجيين إلى الحالة الأبوية. لذلك تساوي النسبة المصححة مجموع الفترتين مطروحا منه ضعفا نسبة العبور المزدوج المعدلة. تعرض النتيجة التقدير المستقل والتقدير المعدل كلّا على حدة، كي تتمكن من مراجعة جميع خطوات الحساب بوضوح.

ميز بين طول الخريطة وإعادة التركيب الخارجية

فسر مسافة الخريطة الإضافية على أنها الطول الجيني المقدر الممتد عبر الجينات الثلاثة. أما النسبة المصححة لإعادة التركيب الخارجية فتمثل حصة الأمشاج التي ستبدو مؤتلفة إذا رصدت A وC فقط وفق الافتراضات المحددة. تجيب النتيجتان عن سؤالين مختلفين، ولذلك لا يجوز استخدام إحداهما بدلا من الأخرى. يحتفظ الطول الإضافي بإسهامات العبور في الفترتين، بينما يخفي رصد الواسمين الخارجيين حالات العبور المزدوج. تزداد أهمية هذا الفرق كلما طالت إحدى الفترتين. يعتمد الحساب التقريب التقليدي الذي يعامل قيمة السنتيمورغان لكل فترة كنسبة إعادة تركيب عند تقدير العبور المزدوج. يناسب ذلك مسائل التعليم التقليدية والفترات القصيرة نسبيا. أما الفترات الطويلة أو الاستدلال الرسمي فتتطلب أعداد النسل ودالة خريطة مناسبة أو نموذج احتمالية. سجل مسافتي الفترتين وترتيب الجينات ومعامل التطابق والتصحيح مع النتيجة حتى يستطيع قارئ آخر إعادة إنتاج الحساب.

حالات الاستخدام

مراجعة مسألة خريطة وراثية ثلاثية النقاط

تحقق من الامتداد الإضافي وتصحيح العبور المزدوج بعد تحديد الجين الأوسط.

مقارنة مسافة الخريطة بإعادة التركيب المرصودة

وضح لماذا قد تكون إعادة التركيب بين الجينين الخارجيين أقل من طول الخريطة المجموع.

نمذجة التداخل بين عمليات العبور

استخدم معامل تطابق معلوما لتعديل التواتر المتوقع للعبور المزدوج.

الأسئلة الشائعة

ما مسافة الخريطة الجينية الإضافية؟

هي مجموع مسافتي A-B وB-C بالسنتيمورغان، وتمثل الامتداد المرسوم من A إلى C مرورا بـB.

لماذا يطرح العبور المزدوج مرتين؟

يدخل العبور المزدوج مرة في كل فترة، لكنه يعيد العلاقة الأبوية بين الجينين الخارجيين، ولذلك يجب إزالة الإسهامين معا.

ما معامل التطابق الذي ينبغي استخدامه؟

استخدم 1 عند افتراض استقلال عمليات العبور. واستخدم قيمة تجريبية أقل من 1 لتمثيل التداخل الإيجابي.

هل تحدد الحاسبة ترتيب الجينات؟

لا. تفترض أن ترتيب A-B-C معلوم مسبقا، وتتطلب مسافتي الفترتين المتجاورتين.

ما تكلفة الحساب عبر API؟

تكلف كل مطالبة عبر API مبلغ $0.002. ويمكن أيضا تنفيذ الحساب الحتمي نفسه في المتصفح.

للمطوّرين — الوصول عبر API

كل ما في هذه الصفحة متاح برمجيًا. هذا القسم موجّه للفرق التقنية التي تريد ربط الأداة بأنظمتها الخاصة؛ بقية المستخدمين يمكنهم استخدام الأداة أعلاه مباشرة دون الحاجة لقراءة ما يلي.

الـEndpoint

POSThttps://api.kit.forhosting.com/bio/map-units-additive

صادِق على طلبك بترويسة Bearer، وأرسل طلب POST واحدًا لتدخل مهمتك قائمة التنفيذ فورًا؛ ثم تستلم النتيجة عبر webhook أو رابط موقّع.

استدعِ الخدمة من بيئتك

curl -X POST https://api.kit.forhosting.com/bio/map-units-additive \
  -H "Authorization: Bearer $KIT_KEY" \
  -H "Content-Type: application/json" \
  -d '{"distance_ab_cm":12,"distance_bc_cm":8}'

const res = await fetch("https://api.kit.forhosting.com/bio/map-units-additive", {
  method: "POST",
  headers: {
    "Authorization": `Bearer ${process.env.KIT_KEY}`,
    "Content-Type": "application/json"
  },
  body: JSON.stringify({
    "distance_ab_cm": 12,
    "distance_bc_cm": 8
  })
});
const { task_id } = await res.json();

import os, requests

res = requests.post(
    "https://api.kit.forhosting.com/bio/map-units-additive",
    headers={"Authorization": f"Bearer {os.environ['KIT_KEY']}"},
    json={
    "distance_ab_cm": 12,
    "distance_bc_cm": 8
},
)
task_id = res.json()["task_id"]

<?php
$res = file_get_contents("https://api.kit.forhosting.com/bio/map-units-additive", false, stream_context_create([
  "http" => [
    "method"  => "POST",
    "header"  => "Authorization: Bearer " . getenv("KIT_KEY") . "\r\nContent-Type: application/json",
    "content" => '{"distance_ab_cm":12,"distance_bc_cm":8}',
  ],
]));
$task = json_decode($res, true);

body := bytes.NewBufferString(`{"distance_ab_cm":12,"distance_bc_cm":8}`)
req, _ := http.NewRequest("POST", "https://api.kit.forhosting.com/bio/map-units-additive", body)
req.Header.Set("Authorization", "Bearer "+os.Getenv("KIT_KEY"))
req.Header.Set("Content-Type", "application/json")
res, _ := http.DefaultClient.Do(req)

مثال على الطلب

{
  "distance_ab_cm": 12,
  "distance_bc_cm": 8
}

مثال على الاستجابة

{
  "task_id": "tsk_a1b2c3d4e5f6a1b2c3d4e5f6",
  "type": "bio.map_units_additive",
  "status": "queued",
  "_links": {
    "result": "/tasks/tsk_…/result"
  }
}

الواجهة غير متزامنة: تستلم task_id فور الإرسال، ويمكنك الاستعلام عن الحالة بمعدل طلب واحد في الثانية.

الأسعار

لكل طلب$0.002

السعر معلن كما تراه: لا tokens ولا نظام نقاط؛ وإن فشلت المهمة فلن تُحاسَب عليها.

الأخطاء

HTTP	الرمز	المعنى
`401`	`unauthorized`	مفتاح الوصول مفقود أو غير صالح؛ تحقق من ترويسة Bearer في طلبك.
`402`	`insufficient_balance`	رصيدك لا يكفي لتنفيذ هذه المهمة؛ أعد شحن الرصيد ثم أعد المحاولة.
`404`	`unknown_type`	نوع المهمة المطلوب غير موجود في الكتالوج — راجع الاسم المرسل في الطلب.
`429`	`rate_limited`	تجاوزت الحد المسموح من الطلبات؛ انتظر قليلًا ثم أعد المحاولة.

اطّلع على توثيق KIT الكامل ←